Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC3GQ9HC16 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms