Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GFRA4Q9GZZ7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms