Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCO2Q9BYV7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms