Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms