Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MXD3Q9BW11 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms