Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMM29Q9BSF4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms