Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MESP1Q9BRJ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms