Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VKORC1Q9BQB6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VKORC1Q9BQB6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms