Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF12Q96QT6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms