Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A9Q96Q91 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms