Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms