Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM2

ZNF462, Zinc finger protein 462, humanhuman

Predictions only

Length 2,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF462Q96JM2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF462Q96JM2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF462Q96JM2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms