Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms