Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms