Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms