Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF21BQ96EK2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF21BQ96EK2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms