Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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