Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms