Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSMEM1Q8WWF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms