Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms