Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms