Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF4Q8WV16 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF4Q8WV16 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms