Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELBQ8NG08 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms