Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms