Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC9Q6ZRR7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms