Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms