Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms