Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms