Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf84Q5VXU9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms