Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms