Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms