Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms