Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf21Q32NC0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms