Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms