Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC27Q2M243 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms