Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms