Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACKR1Q16570 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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