Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CNGA3Q16281 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA3Q16281 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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