Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUL1Q15846 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUL1Q15846 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms