Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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