Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

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Length 3,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPEGQ15772 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms