Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1CQ15572 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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