Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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