Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPAQ15257 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPAQ15257 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms