Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PRKD1Q15139 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PRKD1Q15139 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKD1Q15139 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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