Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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