Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM53BQ14153 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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