Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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COL4A6Q14031 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL4A6Q14031 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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