Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms