Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms